Το 5ο Δημοτικό Σχολείο Πετρούπολης ιδρύθηκε με το ΦΕΚ 201/Α/06-10-1966, το οποίο αρχικά συστεγαζόταν μαζί με το 2ο Δημοτικό Σχολείο Πετρούπολης μέχρι το σχολικό έτος 1994-95.
Μετά την ανέγερση του σημερινού κτιρίου (1995), το σχολείο λειτούργησε για πρώτη φορά στις νέες κτιριακές υποδομές επί τη συμβολή των οδών Κερασόβου και Αγίου Πολυκάρπου το σχολικό έτος 1995-96, όπου λειτουργεί ως σήμερα.
Κατά το τρέχον σχολικό έτος (2021-22) στο σχολείο λειτουργούν 12 τμήματα και το μαθητικό δυναμικό αποτελείται από 274 μαθητές.
